Portfolio Prof. Dr. Oliver Kohlbacher

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Academic title:
Prof. Dr.
Name:
Oliver Kohlbacher
Organizational units:
Faculty of Science
University of Tübingen
Wilhelm Schickard Institute of Computer Science (WSI)
Department of Informatics
Center for Bioinformatics (ZBIT)
Centers
Quantitative Biology Center (QBIC)
Centers
Links:

Contact data

Curriculum vitae

Research focus

Selected Publications

Ziller MJ, Gu H, Müller F, Donaghey J, Kohlbacher O, Bernstein BE, Gnirke A, and Meissner A. Charting a dynamic DNA methylation landscape of the human genome. Nature 2013, 500:477-481.

Walzer M, Qi D, Mayer G, Uszkoreit J, Eisenacher M, Sachsenberg T, Gonzalez-Galarza FF, Fan J, Bessant C, Deutsch EW, Reisinger F, Vizcaíno JA, Medina-Aunon JA, Albar JP, Kohlbacher O, and Jones AR.The mzQuantML data standard for mass spectrometry-based quantitative studies in proteomics. Mol Cell Prot 2013, 12(8):2332-40

Weisser H, Nahnsen S, Grossmann J, Nilse L, Quandt A, Brauer H, Sturm M, Kenar E, Kohlbacher O,Aebersold R, and Malmström L. An automated pipeline for high-throughput label-free quantitative proteomics. J Proteome Res 2013 (epub ahead of print, DOI: 10.1021/pr300992u)

Gifford, CA, Ziller, MJ, Gu, H, Trapnell, C, Donaghey, J, Tsankov, A, Shalek, AK, Shishkin, AA, Issner, R, Zhang, X, Fostel, JL, Holmes, L, Meldrim, J, Guttman, M, Epstein, C, Park, H, Kohlbacher O, Rinn, J, Gnirke, A, Lander, ES, Bernstein, BE, and Meissner, A. Transcriptional and Epigenetic Dynamics during Specification of Human Embryonic Stem Cells. Cell, 2013, 153(5):1149-1163.

Nahnsen S, Bielow C, Reinert K, and Kohlbacher O. Tools for label-free peptide quantification. Mol Cell Prot, 2013,12(3):549-56.

Projects

2019 - 2025
Philipp Berens, Ulrike Luxburg
Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V. (DFG)
2019 - 2023
Heike Brötz-Oesterhelt
Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V. (DFG)
2018 - 2022
Sven Nahnsen, Oliver Kohlbacher
Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V. (DFG)
2018 - 2022
Matthias Bethge
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2017 - 2021
Oliver Kohlbacher
Europäische Union (EU)
2017 - 2020
Oliver Kohlbacher
Ministerium für Soziales und Integration Baden-Württemberg
2017 - 2019
Oliver Kohlbacher
Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V. (DFG)
2016 - 2018
Thomas Walter
Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kunst Baden-Württemberg (MWK)
2016 - 2019
Oliver Kohlbacher
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2016 - 2018
Sven Nahnsen
Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V. (DFG)
2015 - 2018
Oliver Kohlbacher
Europäische Union (EU)
2015 - 2020
Oliver Kohlbacher
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2015 - 2018
Oliver Kohlbacher
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2015 - 2018
Oliver Kohlbacher
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2014 - 2017
Oliver Kohlbacher
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)

Cooperations

ETH Zürich - Eidgenössische Technische Hochschule Zürich
Zürich, Switzerland
Universität Salzburg
Salzburg, Austria
Hungarian Academy of Sciences (MTA)
Budapest, Hungary
Ghent University
Gent, Belgium
Harvard University
Cambridge, Massachusetts, United States of America

Publications

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