DataPLANT – Daten in Pflanzen-Grundlagenforschung

01.10.2020 bis 30.09.2025

In der modernen hypothesen-basierten Forschung sind Wissenschaftler zunehmend auf Dienste und Infrastrukturen für Forschungsdatenmanagement (FDM) angewiesen, die die Erfassung, Verarbeitung, den Austausch und die Archivierung von Forschungsdatensätzen erleichtern. Dabei ermöglicht FDM erst die Verknüpfung von interdisziplinärer Expertise, sowie Vergleich und Integration verschiedener Analyseergebnisse mit dem darauf beruhenden immensen zusätzlichen Erkenntnisgewinn. Das Ziel des Projektes DataPLANT ist es, diesen Mehrwert für den Bereich Pflanzen-Grundlagenforschung zu avancieren. In der Pflanzen-Grundlagenforschung werden die (molekularen) Prinzipien des pflanzlichen Lebens erforscht, die Pflanzenwachstum, Ernteertrag und Biomasseproduktion bestimmen. Die hierzu eingesetzten Methoden von Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik bis hin zu bildgebenden Verfahren erzeugen hochdimensionale polymorphe Daten, die verarbeitet und zusammengeführt interpretiert werden müssen. Erfolgreiche Zusammenarbeit und Nutzung von Daten unterschiedlicher Modalitäten – aus vielen Quellen und Experimenten, vorverarbeitet oder analysiert mit einer Vielzahl von Algorithmen – erfordert eine Kontextualisierung der Daten. Die FAIR Data and Linked Open Data-Prinzipien bieten entscheidende Richtlinien für FDM. Verschiedene Konsortien haben daher Vorschläge zur besten Vorgehensweise und Erfüllung dieser Grundsätze gemacht, doch ist es fast immer an der Initiative der einzelnen Forscher, diese auch umzusetzen. Daher stehen umfassende Informationen über die erforderliche Qualität für die Verwendung durch Dritte oft nur in selten Fällen zur Verfügung. Es hat sich gezeigt, dass Forscher praktische Unterstützung bei der Nutzung der fragmentierten und komplexen Ressourcenlandschaft benötigen. Dies erhöht die Notwendigkeit einer maßgeschneiderten (Infra)struktur für FDM. Durch den Zusammenschluss von technisch-fachlicher Expertise in den Bereichen Pflanzen-Grundlagenforschung, Informations- und Computerwissenschaften und Infrastrukturspezialisten wird DataPLANT Pflanzenwissenschaftlern im Umgang mit Forschungsdaten individuell angepasst unterstützen. Dabei wird DataPLANT eine Serviceumgebung schaffen, um Forschungsdaten nach den FAIR-Prinzipien mit minimalem Zusatzaufwand zu kontextualisieren und den gesamten Forschungszyklus in der modernen Pflanzenbiologie zu unterstützen. Die maßgeschneiderte Servicelandschaft in DataPLANT wird sich aus technisch-digitaler Assistenz sowie personelle Vor-Ort-Assistenz zusammensetzten. DataPLANT schafft so einen zentralen Einstiegspunkt und eine wertvolle fachspezifische Daten- und Wissensressource. In Verbindung mit Lehre und Trainingskonzepten wird das Sachverständnis im Umgang mit Daten gestärkt und eine Langzeitmotivation zur Schaffung wohlannotierte Datenobjekte erzeugt. Durch die Integration der Pflanzenwissenschaft in das Gesamtnetzwerk NFDI, treibt DataPLANT den digitalen Wandel und die Demokratisierung der Forschungsdaten im Feld voran.