ProjektDesigner-Transcription Activator-Effector-Chromatin-Affinitätsreinigung (dTALE-ChAP) - eine neuartige in planta…
Grunddaten
Titel:
Designer-Transcription Activator-Effector-Chromatin-Affinitätsreinigung (dTALE-ChAP) - eine neuartige in planta Methode zur Aufklärung der Proteinbesetzung eines jeden Promoters der Wahl
Laufzeit:
01.08.2019 bis 31.07.2022
Abstract / Kurz- beschreibung:
Die Dynamik des Proteoms und seine posttranslationale Regulation, die mit einem bestimmten Promotor verbunden ist, ist entscheidend für seine Aktivität als Reaktion auf Entwicklungsprozesse und Umwelteinflüsse. In Pflanzen gibt es jedoch noch keine Technik, die die quantitative In-vivo-Bestimmung Promotor-assoziierter Proteome ermöglicht. Das Projekt zielt darauf ab, eine solche Technik zu etablieren, die als Designer Transkriptionsaktivator-Chromatin-Affinitätsreinigung (dTALE-ChAP) bezeichnet wird. dTALE-ChAP basiert auf GFP-markierten dTALEs, die nach extern induziertem Transfer in den Kern spezifische DNA-Regionen innerhalb eines Promotors der Wahl erkennen und zur Affinitätsreinigung des nahegelegenen Chromatins verwendet werden. Anschließend werden das Chromatin-assoziierte Proteom und seine posttranslationale Modifikation durch Massenspektrometrie analysiert.
Schlüsselwörter:
Proteomik
proteomics
Massenspektrometrie
mass spectrometry
dTALE-ChAP
Promoter
DNA-Protein Interaktion
Transkriptionsfaktor
Beteiligte Mitarbeiter/innen
Leiter/innen
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Universität Tübingen
Universität Tübingen
Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP)
Fachbereich Biologie, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Fachbereich Biologie, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
SFB 1101 - Molekulare Kodierung von Spezifität in pflanzlichen Prozessen
Sonderforschungsbereiche und Transregios
Sonderforschungsbereiche und Transregios
Lokale Einrichtungen
Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP)
Fachbereich Biologie
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Geldgeber
Bonn, Nordrhein-Westfalen, Deutschland