Development of essential software and community resources for modeling in systems biology in Java™

01.09.2016 bis 30.04.2020

Rechnergestützte Modellierung gewinnt immer mehr an Bedeutung in der biomedizinischen Forschung. Die systembiologische Modellierungssprache SBML hat sich als de-facto-Standard-Format etabliert, um Modelle zwischen vielfältigen Modellierungsprogrammen auszutauschen. Software-Entwickler und Forscher, die Modellierungssoftware entwickeln, profitieren von der Verfügbarkeit von quelloffenen Software-Resourcen für SBML, da sie auf eine grundlegende und ausgereifte Infrastruktur zurückgreifen können. Das Ziel dieses Projektes besteht darin, zahlreiche Software- und Datenbanklösungen zu verbessern, die sich als essentiell für die SBML-Nutzer erwiesen haben. Software-Entwicklung für verbesserte Interoperabilität mit weiteren Formaten und das Erstellen geeigneten Lehrmaterials über SBML sind weitere Schwerpunkte. Dabei liegt der Fokus hauptsächlich auf der Java-Bibliothek JSBML und ihrer Anwendung zur Modellierung von Krankenhauskeimen.