Metabolic engineering of probiotic bacteria for microbiome control and infection treatment

01/08/2026 to 31/07/2028

Das Projekt zielt auf die gezielte Nährstoffsteuerung in Mikrobiomen ab und umfasst drei Arbeitsbereiche: (1) Einsatz der Hochdurchsatz-Metabolomics der Gruppe, um zu kartieren, welche Zucker und Glykane in Darm- und Nasenmikrobiomen verfügbar sind; (2) „Sugar Capture", bei dem wir Bakterien so konstruieren, dass sie bestimmte Zucker aufnehmen und in inerten Biopolymer-Speichern festlegen, wodurch Pathogenen diese Nährstoffe dauerhaft entzogen werden; und (3) Engineering von E. coli zur Produktion von Metaboliten, die das Mikrobiom zugunsten schützender Kommensalen verschieben . Zusammen bilden diese Arbeitsbereiche einen Zyklus von der metabolomics-basierten Identifikation relevanter Nährstoffe über die gezielte Produktion oder den Entzug dieser Nährstoffe bis hin zur Validierung in Mikrobiom-Modellen.